导致物流运输企业感觉税负压力大的原因主要在几方面：

      第一，经济不景气，本身生意就不好做，作为客户的制造业节省运输成本，导致物流运输业利润微薄，营改增后税负稍重便对部分企业构成压力；

      第二，企业经营管理不规范。一些投机性的缺乏保障性的小企业，车子租赁、司机雇用，车主、司机身份税务部门难以认定，不易管理协调，不但拿票难，车主还要预留一部分利润，一层层传递上去就会导致运输企业和物流企业抵扣难；

      第三，抵扣范围有限，成本支出较高的项目大多无法抵扣，如路桥费、房屋租金、异地加油费用等。物流运输业经营业务税率不一，准确划分难度较大，也导致抵扣难；

      第四，抵扣范围内的项目抵扣难度较大。即便在试点地区内，仅在少数指定的企业进行维修和加油，才能拿到增值税发票，而许多随机需要的加油和维修是在规定企业外发生的。要在可拿增值税发票的油企加油，必须垫付一定额度现金，这比较影响小型企业的正常运作。运输车辆、设备等税改前多已购置到位的企业，无法纳入进项抵扣。

      第五，增值税税率偏高，地方对政策进行自主调整等。

      第六，扶持政策等优惠落实难。一是应许的企业税负增加超过一定额度能获得相关补偿的承诺兑现难，企业也厌烦期间需要查账核定。再者，抵扣流程的操作效率不高，有待改善。